pues con toda esa información que das lo tienes crudo, además, te refieres al touchpad o a un raton?
los portatiles suelen tener una tecla de funcion que lo desactiva. No será por eso?

¿tipo de ratón?
¿lo tienes configurado en tu xorg.conf? ¿puedes hacer un copiar/pegar?
podrías intentarlo configurar a mano dicho archivo (esto depende de tu ratón) por eso es importante saber que ratón es.
¿has movido algo últimamente? , es extraño que las cosas dejen de funcionar mágicamente.